来自中国科学院北京基因组研究所的研究人员对小鼠乳腺发育的怀孕期、哺乳期和退化期小鼠基因表达情况进行转录组学研究。找到一些在乳腺发育过程中起到关键调控作用的蛋白编码基因、转录因子以及miRNAs。文章刊登在2014年第44卷第三期的《中国科学：生命科学》杂志上。
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乳腺是哺乳动物特有的器官,90%的发育过程集中在出生之后.在生殖过程中乳腺发育会经历怀孕、哺乳和退化3个阶段(称为怀孕哺乳周期).为了在转录组水平上更好地了解乳腺发育的机制,研究人员利用核糖体RNA去除法构建了小鼠乳腺3个时期(怀孕12天、哺乳14天和退化7天)的总RNA文库,每个文库产出的数据量均大于5×107条reads。
由于乳腺在怀孕哺乳期形态学以及功能上的巨大改变,对发育不同时间点的乳腺基因表达的研究可以发现形成这些差异的原因.基于基因分类系统以及KEGG(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes)注释,研究得到一系列相关的生物学信息,同时也从RNA-seq基因表达数据中找到一些在乳腺发育过程中起到关键调控作用的蛋白编码基因、转录因子以及miRNAs.在哺乳期大部分下调的基因主要是参与组织重建的功能。
原文摘要：Anorganuniquetomammals,themammaryglanddevelops90%ofitsmassafterbirthandexperiencesthepregnancy-lactation-involutioncycle(PLcycle)duringreproduction.Tounderstandmammogenesisatthetranscriptomiclevelandusingaribo-minusRNA-seqprotocol,weacquiredgreaterthan50millionreadseachforthemousemammaryglandduringpregnancy(day12ofpregnancy),lactation(day14oflactation),andinvolution(day7ofinvolution).Thepregnancy-,lactation-andinvolution-relatedsequencing...
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http://www.ebiotrade.com/emagazine/detail.aspx?mid=13&articleId=0C240DD4-F111-4B11-883B-A82C29FB2635
