目的 本研究旨在建立一种基于 RNA 测序阐明衰老过程中小鼠骨髓组织参与主要功能活动 和细胞过程的特征性变化的研究方案,发掘用于衰老预测和干预的代表性潜在靶点。
方法 提取来自 2、10 和 18 月龄的各 3 只 C57BL / 6J 雄鼠双侧胫骨和股骨的骨髓细胞,经过红细胞裂解处理后提取 RNA 用于 RNA 测序分析。
结果 基因表达量和 Venn 分析的结果显示 2 ~ 10 月龄基因的表达变化以下调为主,10 ~ 18 月 龄则以上调为主,在小鼠成熟发育的过程中基因表达经历了由下调为主向上调为主的变化。 通过京都基因与 基因组百科全书( kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG) 的功能和富集分析以及基因集富集分析 (gene set enrichment analysis,GSEA)关注到的不同年龄阶段小鼠骨髓组织在“免疫系统”“发育和再生”“运输 和分解代谢”“细胞生长和死亡”等通路存在显著的表达差异,其中在炎症、细胞骨架和 DNA 修复通路表现出 持续激活,与逐渐下降的造血功能和波动的免疫调节形成对比。 通过富集通路筛选出的差异表达上调的基因 Bmpr1a 和 Inhba 之间、差异下调的 Dntt 和 Ccnd1 之间以及 Col1a1、Col1a2、Fcgr1、Fyn、Lgmn、Ctsl、Ctsk、Ctss、 Gnail、Myl4 和 Ccr5 之间均存在相互作用, 参与 HSCs 稳态、细胞周期、DNA 损伤修复、免疫调节、细胞凋亡等 功能调控。
结论 本研究提供了不同年龄阶段骨髓组织转录水平基因表达变化的数据,为探究小鼠衰老中骨 髓组织发生的主要特征性变化提供研究策略,发掘揭示衰老的相关基因和信号通路,为延缓衰老和预防衰老 相关疾病提供新的策略。
